纯水微酸水一体机安装完成后，日常模式生成的是3-10mg/L的诊疗用水，供各个牙椅诊疗使用，同时可在设备触摸屏上进行设定，定期定时自动或手动进行管路消毒。
（一）自动模式（牙椅供水管路为循环水路时）
设置每隔30天在第30日当天19:00-19:30(时间可设置）消毒一次，每次持续消毒15分钟，则消毒日当日接诊结束后，19:00开始设备自动排空微酸水水箱中日常模式的微酸水，排空后自动重新生成40-80mg/L微酸水，达到一定高度后，微酸水通过供水泵从循环管路流出并回流至微酸水水箱，持续流动15分钟后自动停止循环，并排空微酸水水箱中的高浓度的微酸水，排空后设备自动切换到日常模式，生成3-10mg/L诊疗用水并继续在水路中持续流动一段时间将水管内残余的40-80mg/L的微酸水排净，微酸水箱及水路内又重新补充了诊疗用水，设备待机，便于次日白天牙椅使用诊疗用水。
牙椅供水管路为循环水路时，设备的工作流程如下：
（二）手动模式（牙椅供水管路为单向水路非循环时）
设置每隔30天在第30日当天消毒一次，则需要在消毒日当日科室所有接诊结束后，从设备设置面板手动切换到消毒模式，消毒模式开启后设备自动排空微酸水箱并开始制备并储存40-80mg/L消毒用水。在此期间工作人员打开每台牙椅上的漱口水及三用喷枪等出水口，一直保持打开状态，水管内残余的3-10mg/L诊疗用水从牙椅出水口流净后，继续持续流出40-80mg/L的消毒用水约15分钟，最后设备切换到日常用水模式，生成3-10mg/L诊疗用水并继续在水路中持续流动将前一阶段水管内残余的40-80mg/L的微酸水排净，关闭每台牙椅各个出水口，设备待机，便于次日牙椅使用诊疗用水。
牙椅供水管路为单向水路（非循环）时，设备的工作流程如下：
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